Susunan organisasi Badan Penanggulangan Bencana Daerah Kabupaten Kutai Kartanegara, terdiri dari :

  1. Kepala Badan;
  2. Unsur Pengarah;
  3. Unsur Pelaksana;

Unsur pengarah sebagaimana dimaksud diatas dipilih melalui uji kepatutan dan kelayakan yang dilakukan oleh DPRD, dan diatur lebih lanjut dengan peraturan Bupati sesuai ketentuan peraturan perundang-undangan yang berlaku.

Unsur pengarah terdiri dari :

  1. Pejabat Pemerintah Daerah;
  2. Anggota masyarakat Profesional dan Ahli.

Unsur pelaksana dipimpin oleh seorang kepala pelaksana yang berada dibawah dan bertanggung jawab kepada kepala Badan. Unsur pelaksana terdiri dari :

  1. Kepala Pelaksana;
  2. Sekretariat, membawahkan;

1.    Sub Bagian Umum dan Kepegawaian;

2.    Sub Bagian Keuangan;

3.    Sub Bagian Penyusunan Program.

  1. Bidang Rehabilitasi dan Rekonstruksi, membawahkan;

1.    Sub Bidang Rehabilitasi;

2.    Sub Bidang Rekonstruksi;

  1. Bidang Pencegahan dan Kesiapsiagaan, membawahkan;

1.    Sub Bidang Pencegahan;

2.    Sub Bidang Kesiapsiagaan.

  1. Bidang Kedaruratan, membawahkan;

1.    Sub Bidang Tanggap Darurat;

2.    Sub Bidang Distribusi dan Logistik.

  1. Bidang Penanggulangan Kabakaran, membawahkan;

3.    Sub Bidang Operasional;

4.    Sub Bidang Sarana dan Prasarana.

  1. Unit Pelaksana Teknis Badan (UPTB);
  2. Kelompok Jabatan Fungsional.